突然橡树死亡基因组的破坏

2017-11-02 01:15:12

作者:Celeste Biever导致突然橡树死亡的真菌病原体的基因组已由美国科学家测序 Blacksburg的弗吉尼亚生物信息学研究所的Brett Tyler和加利福尼亚Walnut Creek的联合基因组研究所的Dan Rokhsar及其同事揭示了在JGI组成Phytophthora ramorum的15,000个基因的6500万长的DNA碱基对序列星期四它是Phytophthora家族中第一个被测序的成员研究人员希望P. ramorum遗传密码的地图能够精确定位基因及其蛋白质,使其能够检测,追踪和治疗疾病该序列的完成恰逢3月份发现受感染的加利福尼亚苗圃通过植物运输在全国范围内传播疾病后,对美国突然橡树死亡蔓延的担忧加剧植物病理学家现在担心东海岸的阿巴拉契亚森林可能会被感染感染不会出现至少一年 “我们现在正在屏住呼吸,”科瓦利斯俄勒冈州立大学的植物病理学家埃弗雷特汉森说在英国和荷兰的托儿所和一些自然公​​园也发现了这种疾病 P. ramorum通过树皮侵入植物,切断食物从叶子到根部的流动最终根部死亡,导致上部树木和四肢因缺水而死亡这种疾病以这种方式杀死了几种橡树和山毛榉它可以感染至少40种其他物种,包括像rhodedendrons和camelias这样的灌木,它们通过叶子上的孢子传播P. ramorum在短期内,科学家们希望基因序列能够根据病原体释放的蛋白质为P. ramorum提供诊断工具目前,在树木在感染后一年或更长时间内出现症状之前,不可能检测到病原体从长远来看,他们希望开展一种选择性治疗现有的处理方法是每年两次将化学品撒在树的整个树皮上,但对所有树木都没有效果 “这是个好消息,”汉森说 “但是,虽然它将成为基础遗传研究的一大福音,但它不会迅速导致对环境威胁的任何减轻”他说研究人员在了解植物疾病方面远远落后于人类加州大学伯克利分校的植物病理学家Matteo Garbelotto选择了测序的P. ramorum菌株他希望在一年内使用诊断工具套件,并在10年内使用治疗但汉森警告说,即使新的治疗方法确实到来,仍然需要解决后勤方面的挑战,